送到肌肉细胞去之后呢，就会依身体的需求可能合成酵素、或是跑去合成肌肉纤维，偶尔也会被拿去作为能量来源。长肌肉（纤维）有两个基本要素：
1、胺基酸原料要够，一个都不能少（All-or-none law）：如前面所说，肌肉纤维就是蛋白质，而它最基本的单元就是胺基酸，而在我们的DNA 里面会记录着要做成肌肉纤维需要哪些胺基酸，如果身体某一种胺基酸库存量不够，就不会合成肌肉纤维。
2、要有刺激（需求）：光是只有原料充足还是没办法好好的合成肌肉纤维，当我们运动（训练）时就会对身体发出我要更多肌肉的需求，这时候身体就会回应这样的需求，开始拿胺基酸来合成更多的肌肉纤维来回应这项的需求。第一点就是好好吃饭就可以搞定。但第二点呢，变数就有点多了，比如说你有运动，那么，什么时候补充蛋白质比较适合呢？是只要多吃就好，还是要看时机点吃哩？
或许你听过这个问题：「运动后什么时候补充蛋白质比较能促进肌肉生长呢？」在营养学期刊里面有一篇老鼠研究或许能帮我们解惑一下。
研究中的老鼠分成两群，一群是什么事都不做，只要爽爽过日子的好命组；另外一组则是训练组，它们一周要上班…不是，是一周要接受耐力训练5 天，每天得在跑步机上跑个60 分钟，速度是每分钟26 公尺，而这样的生活得过六周。研究期间会再将训练组的老鼠分成两半，一半是运动后立刻吃饭；另一外一半则是休息的时候才能吃饭。
研究采用一种名为胺基酸氧化指标（IAAO，indicator amino acid oxidation）的方法来确定老鼠对胺基酸的需求量，而老鼠吃的饲料中的蛋白质含量也会随着测量慢慢往上调，从每天3.3 到37.3 公克/公斤。
最佳补充时机是运动后
结果发现训练后马上吃饭的老鼠对于胺基酸的需求量比其他两组要高出许多，而好命老鼠和有运动但在休息的时候吃饭的老鼠，这两组对于胺基酸的需求量在研究中并没有出现显著的差距。
也就是说，从这个老鼠研究的结果，我们可以知道想要让训练后有最佳的肌肉合成，就要在训练后尽快补充足够的蛋白质食物。当然这只是动物试验，结果仅供参考。 （未来有人类的相关研究再报给大家知道。）
胺基酸氧化指标（Indicator amino acid oxidation, IAAO）
指标胺基酸氧化法的基础概念是当蛋白质合成时，如果某一个必要胺基酸（indispensable amino acid, IDAA）不足的话，此时所有其他的 IDAA 包含 indicator amino acid 将会被氧化掉。
随着限制胺基酸的摄取增加， IAAO 将会减少，而这反映出有较多的胺基酸被拿去合成蛋白质。一旦不足的胺基酸被补充足够了，指标胺基酸的氧化就不会再变化。
本来 IAAO 法是用来设计确定成年人 IDAA 的需求。由于是非侵入式的测量，因此也被用来测量新生儿与儿童以及疾病时的胺基酸需求。