炎热潮湿 食物容易腐败
从先秦时代开始，农历五月被视为毒月，这个季节天气炎热、潮湿多雨，不仅容易孳生细菌、食物腐败，古时山林间更常弥漫有毒的瘴气，各种昆虫、蛇类都在此时出来活动。
古人将蛇、壁虎、蝎子、蟾蜍、蜈蚣视为「五毒」，因五毒出现的时间，也是疫厉流行的季节，为了避免疫病的发生，古人从端午这一天开始避邪、防疫。
自制雄黄 小心过量中毒
为了避邪防疫，古人会在端午这一天喝雄黄酒，明朝李时珍所著的《本草纲目》写着：「雄黄味辛温有毒，具有解虫蛇毒、燥温、杀虫驱痰功效。」雄黄酒是雄黄浸泡米酒或高粱酒而成。
雄黄酒除了服用外，大人也会以手指头沾雄黄酒，在小朋友的额头上写个王字，或在身上其他地方画符，或是在居住处喷洒，但因为雄黄是有毒矿物，含有三硫化砷，如果自己自制雄黄酒，可能容易摄取过量，引发砷中毒。
因为历年发生过多起喝雄黄酒引发砷中毒事件，邱世文建议民众不要自制雄黄酒饮用，如有需要，可改以外用较为安全，最好不要内服。
艾草菖蒲 避邪清新空气
除了雄黄酒外，古人在端午这天，会在门口挂上艾草、菖蒲，古书《荆楚遂时记》描写当时情景：「五月五日……采艾以为人形，悬门户上，以袪毒气。」邱世文表示，艾草代表百福，是菊科多年生草本植物，是一种可以治疗疾病的药草，传说插在门口可以保身体健康，菖蒲的叶子为剑形，象征驱除不祥的宝剑，插在门口取避邪之效。
艾叶在本草书中记载：「苦辛，温热，纯阳之性。能回垂绝之元阳，通十二经…理气血。」菖蒲在药书中记载：「辛苦而温，芳香而散，补肝益心，开心孔，利九窍，明耳目发音声。去湿逐风，除痰消积，开胃宽中。」
以现代观点来看，端午节因潮湿炎热，容易孳生病菌，在门口悬挂菖蒲、艾草，可以取其香气清节空气，减少病菌孳生，远离疫疠疾病。
冰冷食物 易致身体不适
无论古时或现代，端午时节开始都是潮湿炎热的气候，所以自古开始，便流传端午过后才收冬衣的习俗。而此时节容易孳生病菌，引发传染病，尤其现代人饮食不正常，天气热又喜欢吃冰冷食物，更容易引发身体不适，像是肠胃型感冒、急性细菌型痢疾、肠病毒等都是端午节气常见的传染病。
朱文铭建议民众平日应该将屋内、屋外清扫干净，避免蚊虫孳生。外出用餐时对于食物清洁也要特别小心注意，少吃冰冷食物，并维持规律运动，提升抵抗力，降低感染疾病机会。
人工香料香包 易刺激呼吸道
除了悬挂菖蒲、艾草之外，古人也会在端午节时配戴香包，取化湿避秽之效，礼记记载：「男女未冠笄，衿缨皆佩容臭。」容臭就是香包，香包内有朱砂、雄黄及中药草，常用的有艾草、菖蒲、檀香、薄荷等，具有杀虫灭菌、刺激肠胃蠕动、清心醒脑之效。
香包内的材料在中药房都买得到，古人配戴的香包会做成小鸡、小虎等各种可爱造型，再用红线绑在身上，现在的香包更加多样化，但不少业者为了减少药草成本，改以人工香料取代。
化学香料如果吸取过量，可能会刺激呼吸道造成不适，甚至会因为与肌肤的接触造成皮肤过敏不适，建议民众可自行到中药行购买材料自制香包。